Ayesha Müller-Wolfertshofer absolvierte von 2010 bis 2015 den Bachelorstudiengang Architektur am Vidyavardhan’s IDEA – Institute of Design Environment and Architecture in Indien. Anschließend setzte sie ihr Studium an der Hochschule für angewandte Wissenschaften München fort, wo sie von 2015 bis 2017 den Masterstudiengang Architektur mit der Vertiefungsrichtung Städtebau abschloss. Während und nach ihrem Studium sammelte sie berufliche Erfahrungen in verschiedenen Architektur- und Stadtplanungsbüros. Seit Juni 2020 ist sie als Architektin bei der Bayerischen Architektenkammer eingetragen. Von Januar 2020 bis Januar 2026 promovierte sie unter der Betreuung von Prof. Dr. Benedikt Boucsein zum Thema der Neugestaltung informeller Siedlungen in Mumbai; ihre Promotion wurde von Oktober 2020 bis September 2024 durch ein Promotionsstipendium der Hanns-Seidel-Stiftung gefördert und mit der Auszeichnung magna cum laude abgeschlossen. Von Oktober 2024 bis September 2025 war sie als wissenschaftliche Mitarbeiterin im Forschungsprojekt „Familienwohnen in Gemeinschaft und Nachbarschaft (FaGeNa)“ an der Professur für Urban Design tätig. Seit Januar 2026 ist sie Laura-Bassi-Stipendiatin und forscht zum Thema Transit-Oriented Development, wobei sie zugleich ein eigenständiges Forschungsprojekt entwickelt.